
拜谱生物正式推出基于化学蛋白质组学的衣康过酸掩盖淀粉酶组学产品,实现1000+深奥度绘制位点检测,安全显现典型靶点,全方面生信探讨解析靶点蛋白功能信息,发现新靶点,并提供从“看到”到“手机验证”全方案服务性,为深度理解衣康酸及其衍生物在不同疾病研究中的作用机制提供重要依据。
PART 1
01、测试工作流程
02、测试数据库数据库
03、经“点”显现
在试验数值中,查出很多文献资料中有关资料的经典英文靶点基本衣康酸呈现位点,如第一名个被发现了的衣康酸共价呈现血清酶KEAP1,另外还有糖酵解信号通路中的3个重中之重酶如LDHA、GAPDH、ALDOA,以其炎性小体组合而成血清酶NLRP3和组织烂掉的时候中的重中之重血清酶RIPK3等,其质谱图下面的图表达。
04、类产品优势特点
1.重量质控
商业性的化特女性朋友探头孵育、SDS-PAGE测量、WB手机验证、子样本有关于性数据分析等一定要多座向位测量,事关该项目最终结果安全可信度。2.性能较高指标质谱器材机构
在Orbitrap Astral全新一波的人高粪便质谱仪加持咒下,构建衣康过酸表达位点及血清监定新深浅,助力器科学的的研究新会发现。3.全步奏站台式服务保障
针对拜谱生态学更加完善的测试平台网站,可展示“细胞系提升→探头孵育→WB检则→举重若轻度衣康碱化突显检则→个性化生信概述→当前位点PRM手机验证”全具体步骤业务,省时省劲更更省心。05、进行分析项目(那部分)
06、应运的方向
PART 2、专著手机分享
文章一
日语宝贝标题:Chemoproteomic profiling of itaconation by bioorthogonal probes in inflammatory macrophages(Journal of the American Chemical Society,Q1,2020)
简体中文大标题:炎症巨噬细胞中生物正交探针的化学蛋白质组学分析
的研究信息:本研究首次报道了基于衣康酸类似物OI,设计合成了适用于活细胞标记的衣康酸生物正交探针(ITALK),并实现了对炎症巨噬细胞中衣康酸修饰位点的直接鉴定。共鉴定出862个衣康酸化蛋白、1131个半胱氨酸位点,且存在18个赖氨酸和8个组氨酸的衣康酸修饰。这些修饰底物中包括了许多参与到炎症免疫响应和宿主防御相关调节通路中的关键蛋白,例如炎性小体、信号转导、转录和细胞死亡相关蛋白,暗示衣康酸可通过调节多种通路来影响巨噬细胞功能。作者们选取了几个新发现的修饰蛋白BRI3B、WIPI3和RIPK3并通过点突变实验对其修饰位点进行了验证。本研究为理解衣康酸在巨噬细胞炎症反应中的作用机制提供了丰富的数据支持。
(图源:Qin, Wei et al.,J Am Chem Soc. 2020)
医学文献二
因为标题格式:4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation(Cell Reports,Q1,2023)
中文版子标题:4-辛基衣康酸通过阻断STING蛋白棕榈酰化来抑制其活性
探析资源:cGAS-STING轴在防御外来病原体和维持免疫稳态中起着至关重要的作用。虽然在了解巨噬细胞活化过程中发生的代谢变化方面已经取得了实质性的进展,但对这些代谢变化如何影响cGAS-STING轴却知之甚少。在这项研究中,作者确定衣康酸的衍生物4-辛基衣康酸(4-OI)抑制cGAS-STING的激活。此外,作者发现4-OI抑制cGAS-STING相关的抗病毒免疫反应和自身免疫性炎症。然而,作者发现内源性衣康酸不影响cGAS-STING激活,表明4-OI和衣康酸的功能不同。从机理上讲,研究发现4-OI直接烷基化STING上的Cys91,阻断STING棕榈酰化和寡聚化。4-OI对STING的烷基化代表了STING的另一种翻译后修饰(PTMs)。该研究的发现揭示了cGAS-STING功能通过4-OI烷基化进行调节的机制,并为不同类型PTMs之间的串扰提供了见解。
(图源:Su, Chaofei et al.,Cell Rep. 2023)
PART 3、范例ip产业构思
蛋白质的S-脂酰化(S-acylation)是指脂肪酸与半胱氨酸的巯基通过硫酯键相连。最典型的是棕榈酸,即S-棕榈酰化。催化这一反应的酶属于蛋白质酰基转移酶(protein acyltransferase,PAT)家族,含有DHHC(Asp-His-His-Cys)序列,所以称为DHHC-PAT。由于DHHC基序形成锌指结构域,因此编码这些酶的基因称为含锌指DHHC(zDHHC)。现已发现24种人类zDHHC基因,命名为zDHHC1- 24(无zDHHC10,有zDHHC11B)。这些zDHHC之间的底物亲和力和催化活性差异很大,其中zDHHC17和zDHHC13具备很强的底物融入业务能力,而zDHHC3和zDHHC7具有高效的S-酰化作用。
S-棕榈酰化通过两步机制进行(如下图)。第一步是DHHC基序中的半胱氨酸残基被来自棕榈酰-CoA的棕榈酸酰化,形成酰基酶中间体,这一步通常称为自棕榈酰化。第二步是将棕榈酰基部分转移到蛋白质底物中的半胱氨酸巯基上。
(图源:Anderson, Alison M et al.,NPJ Breast Cancer. 2016)
值得一提的是,在拜谱生态学衣康碱化淡化组试验信息中,发现zDHHC13有3个半胱氨酸残基被衣康硝化作用呈现(有以下图)。不妨设想,zDHHC13的半胱氨酸残基被衣康酸烷基化,影响其自棕榈酰化,进一步影响其靶蛋白的棕榈酰化,进而影响相应的生物学功能,为相关机制机理研究提供新思路。
PART 4、拜谱总结
看作TCA重复中的当中排泄率物,衣康酸自动调节排泄率、免疫力抗体检测和慢性的发病彼此的彼此系统,为的开展免疫力抗体检测慢性的发病性的发病供给了代换的开展方案。衣康酸形式中的亲电性α,β-不达到饱和状态羧酸形式能对淀粉酶质上的活力性半胱氨酸残基实现烷基化表达(迈克尔加的反应迟钝),这些译文资料后表达被分为“衣康酸表达(itaconation)”,因此直接影响淀粉酶质系统,政策调控免疫力抗体检测对答和排泄率条件,为很多种的发病药材研发部供给新总体目标。拜谱生物作为国内领先的多组学公司,全新推出基于化学蛋白质组学的衣康碱化淡化蛋清组学产品,在全流程高精密仪器和高特异性生物正交探针加持下,可实现高精度、高深度的一站式衣康酸化修饰组检测。另外,可搭配拜谱生物生物学絕對按量靶向治疗分解代谢组(QMT1000)或消耗的能量消化吸收率靶向疗法消化吸收率组物料对衣康酸及其类似物进行靶向绝对定量检测。多组学强强联手,有助于深入理解衣康酸化修饰的功能及其调控机制,为疾病机制机理研究提供科学依据,从而在指导靶向药物设计、疾病治疗等方面创造无限可能。欢迎咨询!
参阅论文
1. Qin W,Zhang Y,Tang H, et al. Chemoproteomic Profiling of Itaconation by Bioorthogonal Probes in Inflammatory Macrophages. J Am Chem Soc. 2020;142 (25):10894-10898. 2. Su C,Cheng T,Huang J, et al. 4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation. Cell Rep. 2023;42 (9):113040. 3. Anderson AM,Ragan MA. Palmitoylation: a protein S -acylation with implications for breast cancer. NPJ Breast Cancer. 2016;2:16028.