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Microb Cell Fact | 遵义医科大学冯昆团队揭示无柄灵芝培养物产生灵芝酸的机制

发布时间：2024-07-25

三萜类化合物已出现出多方面的怪物活力性，是指抗恶性肿瘤和抗病性毒用处。大多数，三萜是使用甲羟戊酸方式镶嵌的，并从天然水树木和白色念珠菌中提现。遵义医科大学冯昆团队在Microb Cell Fact（IF=6.4）上撤稿了一篇“Biotransformation of triterpenoid ganoderic acids from exogenous diterpene dihydrotanshinone I in the cultures of Ganoderma sessile”的科研论文提纲。该科研出现三萜类氧化物野生灵芝粉酸（GA）是用液态体培养出来的无柄野生灵芝粉菌丝体中二萜15,16-二氢丹参酮I（DHT）的微生物技术转为发生的。按照转录组和血清质组学技能进一部探讨无柄虫草菌丝体中DHT发生二种虫草酸（GA）的制度化，并依照两组学技能检侧到的差别的什么是基因和差别的血清，推断出DHT 微生物技术合并 GA 的有效途径。拜谱生物提供了转录组测序和TMT定量蛋白质组学技术，为研究二萜生物转化为三萜提供了丰富的组学信息和候选基因。

文章名称：Biotransformation of triterpenoid ganoderic acids from exogenous diterpene dihydrotanshinone I in the cultures of Ganoderma sessile（Microb Cell Fact，IF=6.4，2023.7）

客户单位：遵义医科大学

研究材料：无柄灵芝真菌菌丝体

拜谱提供技术：转录组测序、TMT定量蛋白质组学

研究结果

1.转录酚类化合物析和性能分级

在对无柄灵芝粉真菌感染菌丝体实行转录组测序共受到67230个转录本和1429九个单什么是基因遗传遗传。在这部分单什么是基因遗传遗传中，49俩被签定为之间的关系表述什么是基因遗传遗传（DEGs），这当中213个表述调整，279个表述变动（图1A）。GO聚集定性了解后，DEGs分为生物制品时（BP）、細胞化学成分（CC）和氧分子功能表（MF）3类。在BP行业种类中，出現了前两个子行业种类：四环素葡萄糖阳极氧化分解时，冰醋酸盐分解时和甲酸盐分解时;而在CC行业种类中，細胞外区、突触组合体、突触设计是前两个亚类。这对于MF行业种类，甲酸脱氢酶（NAD）吸附性酶、阳极氧化恢复备份酶吸附性酶和酸氨（或酰胺）连接方式酶吸附性酶是前两个亚行业种类（图1B）。在DEGs的KEGG环路定性了解中，前30条聚集度很高的环路含有27条包括分解，这当中二氧化氮分解、乙醛酸盐和二羧酸盐分解、丙酸盐分解数据信号环路同质性聚集（图1D）。

图1|转录成分析和功能键等级分类

(图源：Wang X., et al., Microb Cell Fact., 2023)

2. 蛋白质组定量分析和功能分类

采用对无柄虫草病菌菌丝体完成球胆固醇组学了解，加起来判断了16,457种显著肽、2606种球胆固醇和2588种一定量球胆固醇。在阈值法|FC|>1.2和p<0.05的淘汰條件下，这2606种球胆固醇中，94种被检测为异同体现球营养素酶（DEPs），这之中52种上涨，42种降低（图2A），图2C现示了异同体现球营养素酶的聚类算法了解热图。从GO了解来讲，BP等级分类现示，基本上都数DEPs体验冰醋酸盐消化吸收方式、抗菌素溶解消化吸收方式和肿瘤药物溶解消化吸收方式。CC类DEPs在神经元膜外区、过硫化物酶体和微体中分配比例更高，硫化保存酶催化吸附性和甲酸脱氢酶（NAD）催化吸附性在MF类中DEPs的分配比例更高（图2B）。与转录组最后类同，KEGG通道了解现示，有很多DEPs在消化吸收中生态学聚集，这之中3条最生态学聚集的经过是光合生态学中的碳稳定、碳消化吸收和MAPK数据统计通道（图2D）。另外，采用了解GO数据统计库的CC对DEPs完成亚神经元膜wifi定位了解和注音（图2E），DEPs关键布局在神经元膜质（40.66%）、神经元膜膜（17.58%）、线粒体（12.09%）和内质网（8.79%），原理上是GAs生态学转化成的关键地位。

图2|营养物质质组的按量剖析和实用功能认证

(图源：Wang X., et al., Microb Cell Fact., 2023)

3.转录组和蛋白质组数据相关性分析，RT-qPCR验证

维持生计物转变和比组侯选DEGs和DEPs生产制作了维恩图，有20个地域差异表现染色体（图3A）。对转录组和核胆固醇组中E组和C组就有的DEGs/DEPs完成聚类了解法了解，遇到mRNA和核胆固醇两者有14个上浮染色体和4个再降染色体，DEGs与此英译的DEPs表现级别呈正关于，对于Pearson的关于标准值了解，在转录组和核胆固醇组两者检侧到取决于较高的关于性（R = 0.87）（图3C）。实时荧光定量PCR（RT-qPCR）查测可是表现，E组和C组1个DEGs的展现出平行差异性为显著，这里面9个为上涨DEGs，1个为下降DEGs（图3D）。DEGs在RT-qPCR中的展现出态势与转录成分析可是相一致。

图3|蛋白酶质组的化学发光法分折和系统验证通过

(图源：Wang X., et al., Microb Cell Fact., 2023)

拜谱小结

综上所述，该研究结果为真菌对天然产物的生物转化提供了新的见解，这将有助于开发更有效、更经济的方法，以方便的方式获得稀有的三萜。拜谱生物提供了转录组测序、TMT定量蛋白质组学转录组学技术，拜谱生物可提供完善成熟的转录组学、蛋白组学、代谢组学以及多组学联合产品技术服务体系。此外，拜谱生物推出的中药代谢组整体解决方案，基于更丰富、更专业的中药数据库，更高的数据质量、更优质的服务，可进行中药成分分析、中药入血/组织分析、网络药理学等分析，助力客户探索中药前言研究，欢迎致电咨询！

参考文献：Wang X, Wu H, Wong KH, Wang Y, Chen B, Feng K. Biotransformation of triterpenoid ganoderic acids from exogenous diterpene dihydrotanshinone I in the cultures of Ganoderma sessile. Microb Cell Fact. 2023 Jul 28;22(1):139. doi: 10.1186/s12934-023-02156-5.

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