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HEATag:单细胞测序样本标记新方法,低成本、跨物种、全平台兼容!

发布时间:2025-11-10

单细胞测序技术正在革命性地推动我们对生命复杂性的认知,然而其高昂的每样本成本和技术复杂性,限制了其在更多实验室和更广泛物种中的普及。尽管多重样本标记技术能有效“降本增效”,但现有的方法往往受限于抗体阳性植物物种特异形、寡核苷酸绘制成本费用过高或实操流程步骤较为复杂。近日,南方海洋科学与工程广东实验室(广州)的陈凯教受队伍在Journal of Genetics and Genomics上发表了一项创新性方法学研究,提出了一种名为HEATag的新型样本标记策略,为我们提供了一个成本低费用、跨种群、全品台兼容的全新解决方案。

论文期刊概述

Journal of Genetics and Genomics (JGG)是由全球国家学科院隐性基因与骨骼发育生态学学理论研究分析所和全球国家隐性基因学得会主办者的国家学术讨论交流杂志,坚持创新驱动于消息生命安全学科和医学理论研究隐性基因学范围的原创文章性理论研究分析成果展。JGG 2028年度损害细胞7.1,Scopus学术讨论交流杂志评说的指标CiteScore 9.9,位居JCR 2028年度GENETICS & HEREDITY范围Q1区(Top 10%),BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY范围Q1区,位居全球国家学科院杂志区域生态学学类别1区(Top杂志),隐性基因学和生化学与团伙生态学学小类双1区。

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什么样是HEATag

婉转的“二合并”制定

HEATag是由凝集素和HUH内切酶组成部分的交融球蛋白

「分析器」版块 - 凝集素

能够识别细胞膜上广泛存在且高度保守的糖基化表达(如GlcNAc和Neu5Ac)。

「链接器」模组 - HUH内切酶

可以序列特异性地与普通的、无需化学修饰的单链DNA(ssDNA)目录长条形码查询来共价相连。

“1+1>2”的实际效果:将两者融合,得到的HEATag蛋白既能通过凝集素牢牢锚定在细胞膜上,又能通过HUH蛋白携带特定的DNA条形码进行子样本标记符号与追溯。

Fig1: HEATag强有力的加密管控标识远离图示图

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初级教程检查

HEATag应该有可以打?

可不可以在不一要求下,保证哺乳期小动物组织系单组织混样测序

实验室里的设计再精妙,也要经过真实样本的 “实战考验” 才算数。调查项目团队为 HEATag 安装了多轮 “压差测验”,从人体组织细胞系到人体组织细胞结构,从常温下到温度过低,从新鲜样板到固定住样板,全八卦方位认证它的动态平衡性和靠谱性。

第一次轮测试图片对应母乳喂养小动物受损细胞核膜系:探索技术人员选用了是来自于人、鼠、仓鼠五个外来动物群的每种受损细胞核膜(HEK293T、K562、MEF、CHO),在在常温下要 HEATag 标记图片后结合测序。终结收旧的 11447 个受损细胞核膜中,85.66% 都能能够 HEATag 长商品方形码明确适合到原外来动物群,样板间交差感染不多,UMAP 聚类算法分折无论是之间证明文件,HEATag 长商品方形码与外来动物群活性朋友人类基因组特殊性超高不对。 随后,测试测试具体情况进一步推动骤发展:研究分析员试用在 4℃下图标最新神经生殖神经元、在高温下图标甲醇固定不变住神经生殖神经元,乃至单独图标神经生殖神经元核。致使一如既往醒目:所以具体情况下,模本元素与植物物种讯息均更具太好的各种相关,分割准确性率超 95%。虽然甲醇固定不变住会致使重度的转录本对称严重污染,神经生殖神经元核光催化原理都会有大量 RNA 匮乏,神经生殖神经元多种类型的批注致使一如既往与最新模本始终维持不对,验证 HEATag 能够图标各个整理具体情况下的实验英文模本。

Fig2: HEATag 可在不同于條件下来完成单神经细胞转录组混样具体分析

要符号蒲乳期爬行猎物和海洋能无脊椎神经爬行猎物的原代血细胞

如若说体上皮细胞系考试是 “知识基础题”,那组建样品说是 “叠加题”, 这样品往往会因体上皮细胞分类非常复杂、区域适应环境性专项 ,当上标注技木的 “困难”,而 HEATag 刚好在这 “困难” 上表现了优势。

研究团队选择了大鼠和小鼠的睾丸组织开展,这类样本包含精原干细胞、精母细胞、精子细胞等多种类型,对标记一致性的要求极高。实验中,两种动物的睾丸用特异性 HEATag 条形码标记后混合测序,最终获得的 14663 个细胞不仅仅能被准确的鉴别,整个常见细胞膜类别的聚类分析毕竟都清淅可辨。

更令人惊喜的是HEATag对浮游怪物怪物的配适性。HEATag能在海水的等渗溶液中标记新鲜的海洋动物细胞(如海月水母、大西洋海刺水母)。研究人员用人工海水稀释的HEATag 标记了水母和珊瑚的组织细胞后在 BD Rhapsody 平台测序,最终回收的 6452 个细胞中,HEATag 长商品条形码与外来物种转录组兼有较高同样性,就没有显现因高盐大环境引致的 “标识丧失”。后续对甲醇固定的海洋生物细胞测试结果显示,HEATag 在固定样本中的拆分效果优于新鲜样本。

Fig3: HEATag 可做到喂乳绿色组织结构样本量多厚 scRNA-seq 介绍

Fig4: HEATag可构建新鮮浮游生物无脊椎骨哺乳动物重量 scRNA-seq 深入分析

HEATag与内部的结合起来不使得转录组的特殊发生变化

对样本标记技术来说,“不影响样本本身的 RNA 特征” 是底线。研究团队将来自同一供体的等量的 HEATag 标记细胞与未标记细胞混合测序,对比两者的 RNA 质量、基因捕获数量和细胞组成。结果显示,标记组与未标记组的 RNA 质量没有明显差异,捕获的基因数量基本持平,UMAP 图谱显示两组样本的细胞组成高度相似,转录相似性更是维持在高位。无论是细胞簇的注释结果,还是不同细胞类型的基因回收数量,两组都几乎一致,没有出现 “标记导致的基因表达异常”。这意味着,HEATag在提交箭头每日任务的同時,不能对后期的的转录类物质析容易造成不干扰,保证质量了研发信息的完美性。

Fig5: HEATag都不会影响力样例的 RNA 描述模式英文

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未来的发展可期

HEATag 能为单细胞膜研究探讨给我们什么样?

HEATag 的价值量,远禁不住于 “应对标示情况”,它的便捷性和普遍性,将要为单癌细胞理论研究另存越来越多或者性

从操作消费场景去看

HEATag 能合并从 “简单相对浅析”(如癌公司化与普通 公司化、中成药治理与相较比较)到 “大整体范围实验”(如公司化人体体细胞图谱制作、mtk量选择)的全区域具体需求。跟随 PIP-seq、Stereo-cell 等一种新型可优化技術的完善,HEATag 还能进几步完善单人体体细胞实验的通量,力助科研课题技术团队进行挺大整体范围的顶目。

从跨领域潜力股来讲

HEATag 不只是适宜于转录组学,还能与表观遗传基因组学、淀粉酶质组学、室内空间组学等的技艺结合在一起,借助全屋定制数据库索引和寡核苷酸回文序列,HEATag 应该愉快渗透的不同的组学环节,不干扰卫星信号捉捕纵深。同時,为HEATag还应该不断发展单神经元糖组学实验的技艺。

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合伙日常动态

拜谱生物学与陈凯客座教授实现目标初始协议有意愿

适合关心的是,在 HEATag 技木展显现出出不可估量适用潜能的背静下,拜谱菌物制品已与华南地区大海菌物专业与水利工程惠州市调查室(北京)陈凯客座教授实现逐项相互合作有意愿。两人记划紧紧围绕 HEATag 技木的家产化落地实施、科技调查转变成等方位伸展高度协同办公,促进改革某一控制成本预算、跨种类的单癌癌细胞核标示技木快一点适用于现实科技调查不一样,为更好地调查室提供了便捷、成本的单癌癌细胞核调查平台,推助科技调查办公者在癌癌细胞核菌物制品学、大海菌物菌物制品学、疫情系统等方向授予更好地打破
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